Class PDBTemporaryStorageUtils.LinkRecord
- java.lang.Object
-
- org.biojava.nbio.structure.io.util.PDBTemporaryStorageUtils.LinkRecord
-
- Enclosing class:
- PDBTemporaryStorageUtils
public static class PDBTemporaryStorageUtils.LinkRecord extends java.lang.Object
Temporary data storage for LINK records. This is necessary because LINK records precede the atoms they correspond to in a PDB file, so we must store the information encoded in a LINK record until we actually know about the atoms a LINK refers to.- Author:
- Ulysse Carion
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Constructor Summary
Constructors Constructor Description LinkRecord(java.lang.String name1, java.lang.String altLoc1, java.lang.String resName1, java.lang.String chainID1, java.lang.String resSeq1, java.lang.String iCode1, java.lang.String name2, java.lang.String altLoc2, java.lang.String resName2, java.lang.String chainID2, java.lang.String resSeq2, java.lang.String iCode2, java.lang.String sym1, java.lang.String sym2)
-
Method Summary
All Methods Instance Methods Concrete Methods Modifier and Type Method Description java.lang.String
getAltLoc1()
java.lang.String
getAltLoc2()
java.lang.String
getChainID1()
java.lang.String
getChainID2()
java.lang.String
getiCode1()
java.lang.String
getiCode2()
java.lang.String
getName1()
java.lang.String
getName2()
java.lang.String
getResName1()
java.lang.String
getResName2()
java.lang.String
getResSeq1()
java.lang.String
getResSeq2()
java.lang.String
getSym1()
java.lang.String
getSym2()
java.lang.String
toString()
-
-
-
Constructor Detail
-
LinkRecord
public LinkRecord(java.lang.String name1, java.lang.String altLoc1, java.lang.String resName1, java.lang.String chainID1, java.lang.String resSeq1, java.lang.String iCode1, java.lang.String name2, java.lang.String altLoc2, java.lang.String resName2, java.lang.String chainID2, java.lang.String resSeq2, java.lang.String iCode2, java.lang.String sym1, java.lang.String sym2)
-
-
Method Detail
-
getName1
public java.lang.String getName1()
-
getAltLoc1
public java.lang.String getAltLoc1()
-
getResName1
public java.lang.String getResName1()
-
getChainID1
public java.lang.String getChainID1()
-
getResSeq1
public java.lang.String getResSeq1()
-
getiCode1
public java.lang.String getiCode1()
-
getName2
public java.lang.String getName2()
-
getAltLoc2
public java.lang.String getAltLoc2()
-
getResName2
public java.lang.String getResName2()
-
getChainID2
public java.lang.String getChainID2()
-
getResSeq2
public java.lang.String getResSeq2()
-
getiCode2
public java.lang.String getiCode2()
-
getSym1
public java.lang.String getSym1()
-
getSym2
public java.lang.String getSym2()
-
toString
public java.lang.String toString()
- Overrides:
toString
in classjava.lang.Object
-
-